党总支副书记是党总支主要领导成员之一，是党总支书记的主要参谋和助手，对总支委员工作进行协调和指导；总支书记外出，要代替总支书记抓党总支的全面工作，保证党总支工作正常运行。其职责有：
一、协助总支书记开展工作，组织安排系部党员的学习教育和组织生活会。
二、协助总支书记抓好系部党的建设。按照学院党委的统一部署，积极参与制定本系的党员教育计划、党员发展规划和年度工作计划，协助总支书记布置、检查、督促总支部委员和所属党支部工作计划、决定和学院党委工作安排的执行情况。
三、全面负责系部行政工作，了解系部党员和教职工的
思想、工作和学习情况，发现问题及时解决，做好经常性的思想教育工作。
四、全面负责系部学生工作，认真贯彻党的教育方针，
努力做好学生的思想政治教育和管理工作，抓好学风建设，指导规划学生各项教育管理工作。
五、抓好学生入党积极分子的培养教育、组织发展工作，
制定学生党员的教育管理办法。
六、加强辅导员队伍建设，提高辅导员素质，指导、督促其做好学生教育管理工作。
七、配合总支书记做好本系干部的教育和管理。做好干部的选拔、培养、教育、考核、监督和管理工作。
八、积极支持和指导工会、共青团、学生会根据各自章程围绕本系中心任务开展工作。
九、完成学院交办的其他任务。
